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Dirección de Estudios de Posgrado

Brizuela Rodríguez Carlos Alberto

Departamento:Ciencias de la Computación
División:Física Aplicada
SNI:II
Graduado en:Kyoto Institute of Technology
cbrizuel@cicese.mx
23428
https://orcid.org/0000-0003-4621-0380
Publicaciones

Valle Peñuelas, J. L., Panduro Mendoza, M. A., del Rio Bocio, C., Brizuela Rodríguez, C. A., & Covarrubias Rosales, D. H. (2024). Reduction of Phase Shifters in Planar Phased Arrays Using Novel Random Subarray Techniques. Applied Sciences, 14(13), 1-13. https://doi.org/10.3390/app14135917. (ID: 29840)
Brizuela Rodríguez, C. A. (2023, Noviembre). Dos enfoques computacionales para el descubrimiento de nuevos antibióticos. V Simposio de las Licenciaturas, el Posgrado de la DCNI y la Licenciatura en Tecnologías y Sistemas de la Información. Ciudad de México, México (ID: 29372)
Brizuela Rodríguez, C. A. (2023, Noviembre). Aprendizaje de máquina y optimización para la identificación y diseño de péptidos antimicrobianos. Ciclo Internacional de Conferencias de Bioinformática de la Península de Yucatán. Organizado por el IIMAS-UNAM, sede Yucatán, en conjunto con el CIATEJ-Sureste y la Universidad de San Sebastián ¿ Chile. Ciudad de México, México (ID: 29381)
Leyva Labrador, Y. C., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2023, Noviembre). Diseño computacional de péptidos estructurados: resultados preliminares. VIII Congreso de Fisicoquímica, Estructura y Diseño de Proteínas. Juriquilla, México (ID: 29471)
Oliva Moreno, C. A., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2023, Noviembre). Empleo de ESMFold en un algoritmo genético para el diseño de una proteína a partir de un esqueleto polipeptídico determinado. VIII Congreso de Fisicoquímica, Estructura y Diseño de Proteínas. Juriquilla, México (ID: 29470)
Hernández Ayón, S. E., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2023, Octubre). A simple clustering technique for the design of rotamer libraries based on pairs of consecutive residues. IEEE International Autumn Meting on Power, Electronics and Computing (ROPEC) 2023. Ixtapa Zihuatanejo, México (ID: 29466)
Guerrero Vázquez, K., Del Río, G., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2023). Cell-penetrating peptides predictors: A comparative analysis of methods and datasets. Molecular Informatics, 42(11), e202300104. doi: 10.1002/minf.202300104. (ID: 29370)
Brizuela Rodríguez, C. A. (2023, Agosto). Aprendizaje de máquina y optimización en la lucha contra patógenos. VI Coloquio de Simulaciones Computacionales en Ciencias. Ensenada, México (ID: 29463)
Aguilera Mendoza, L., Ayala Ruano, S., Martinez Rios, F., Chávez González, E. L., García Jacas, C. R., Brizuela Rodríguez, C. A., & Marrero Ponce, Y. (2023). StarPep Toolbox: an open-source software to assist chemical space analysis of bioactive peptides and their functions using complex networks. BIOINFORMATICS. doi: 10.1093/bioinformatics/btad506. (ID: 28884)
García González, L. A., Marrero Ponce, Y., Brizuela Rodríguez, C. A., & García Jacas, C. R. (2023). Overproduce and select, or determine optimal molecular descriptor subset via configuration space optimization? Application to the prediction of ecotoxicological endpoints. Molecular Informatics, 42(6), e202200227. doi: 10.1002/minf.202200227. (ID: 29442)
Brizuela Rodríguez, C. A. (2023, Abril). Lucha contra patógenos: dos enfoques computacionales. XXXIII Semana Nacional de Investigación y Docencia en Matemáticas. Hermosillo, México (ID: 29462)
Meléndrez Carballo, G., Guerrero Vázquez, K., García González, L. A., Del Río, G., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2023). Embedded-AMP: A Multi-Thread Computational Method for the Systematic Identification of Antimicrobial Peptides Embedded in Proteome Sequences. Antibiotics, 12(1), 139. doi: 10.3390/antibiotics12010139. (ID: 29369)
García Jacas, C. R., García González, L. A., Martinez Rios, F., Tapia Contreras, I. P., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2022). Handcrafted versus non-handcrafted (self-supervised) features for the classification of antimicrobial peptides: complementary or redundant?. BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS. doi: 10.1093/bib/bbac428. (ID: 28018)
Del Río, G., Trejo Perez, M., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2022). Antimicrobial peptides with cell-penetrating activity as prophylactic and treatment drugs. BIOSCIENCE REPORTS, 42(9), BSR20221789. doi: 10.1042/BSR20221789. (ID: 28365)
García Jacas, C. R., Pinacho Castellanos, S. A., García González, L. A., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2022). Do deep learning models make a difference in the identification of antimicrobial peptides?. BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 16. doi: 10.1093/bib/bbac094. (ID: 27757)
Valenzuela Alcaraz, V. M., Cosío León, M. Á., Romero Ocaño, A. D., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2022). A cooperative coevolutionary algorithm approach to the no-wait job shop scheduling problem. Expert Systems with Applications, (194), 116498. doi: 10.1016/j.eswa.2022.116498. (ID: 28369)
Romero Ocaño, A. D., Cosío León, M. Á., Valenzuela Alcaraz, V. M., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2022). The impact of gradually replacing fossil fuel-powered vehicles with electric ones: A bi-objective optimisation approach. Expert Systems with Applications, 194, 116546. doi: 10.1016/j.eswa.2022.116546. (ID: 28368)
von Lucken, C., Brizuela Rodríguez, C. A., & Barán Cegla, B. (2022). Clustering-based multipopulation approaches in MOEA/D for many-objective problems. COMPUTATIONAL OPTIMIZATION AND APPLICATIONS, 81, 789-828. doi: 10.1007/s10589-022-00348-0. (ID: 28370)
Ricci López, J., Aguila, S., Gilson, M. K., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2021). Improving structure-based virtual screening with ensemble docking and machine learning. Journal of Chemical Information and Modeling. doi: 10.1021/acs.jcim.1c00511. (ID: 27659)
Juárez Jiménez, J. A., Santos, C., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2021). A Comprehensive Review and a Taxonomy Proposal of Team Formation Problems. ACM Computing Surveys, 54(7), 1-33. doi: 10.1145/3465399. (ID: 26925)
Gonzalez, M. R., Martinez Rosas, M. E., Cosío León, M. Á., Cervantes De Ávila, H., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2021). Multiple circle detection in images: a simple evolutionary algorithm approach and a new benchmark of images. PATTERN ANALYSIS AND APPLICATIONS, 24, 1583-1603. doi: 10.1007/s10044-021-01007-6. (ID: 27661)
Pinacho Castellanos, S. A., García Jacas, C. R., Gilson, M. K., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2021). Alignment-Free Antimicrobial Peptide Predictors: Improving Performance by a Thorough Analysis of the Largest Available Data Set. Journal of Chemical Information and Modeling, 61(6), 3141-3157. doi: 10.1021/acs.jcim.1c00251. (ID: 26953)
González Márquez, M. R., Brizuela Rodríguez, C. A., Martinez Rosas, M. E., & Cervantes de Avila, H. (2020, Noviembre). Grape Bunch Detection Using A Pixel-Wise Classification In Image Processing. 2020 IEEE International Autumn Meeting on Power, Electronics and Computing (ROPEC). Ixtapa Zihuatanejo, México (ID: 26547)
Aguilera Mendoza, L., Marrero Ponce, Y., García Jacas, C. R., Chávez González, E. L., Beltrán Verdugo, J. A., Guillén Ramírez, H. A., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2020). Automatic construction of molecular similarity networks for visual graph mining in chemical space of bioactive peptides: an unsupervised learning approach. Scientific Reports, 10, 18074. doi: 10.1038/s41598-020-75029-1. (ID: 26306)
Nava Lara, R., Beltrán Verdugo, J. A., Brizuela Rodríguez, C. A., & Del Río, G. (2020). Relevant Features of Polypharmacologic Human-Target Antimicrobials Discovered by Machine-Learning Techniques. Pharmaceuticals, 13(9), 204. doi: 10.3390/ph13090204. (ID: 26347)
Beltrán Verdugo, J. A., Del Río, G., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2020). An automatic representation of peptides for effective antimicrobial activity classification. Computational and Structural Biotechnology Journal, 18, 455-463. doi: 10.1016/j.csbj.2020.02.002. (ID: 26350)
Brizuela Rodríguez, C. A., & Juárez Jiménez, J. A. (2019). Optimización Evolutiva Multi-objetivo. In Carlos A. Coello Coello (Eds.), Computación Evolutiva (pp. 177-217). Academia Mexicana de Computación. (ID: 26546)
Aguilera Mendoza, L., Beltrán Verdugo, J. A., Guillén Ramírez, H. A., Marrero Ponce, Y., Tellez Ibarra, R., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2019). Graph-based data integration from bioactive peptide databases of pharmaceutical interest: toward an organized collection enabling visual network analysis. BIOINFORMATICS, 35(55), 4739-4747. doi: 10.1093/bioinformatics/btz260. (ID: 25449)
Contreras Torres, E., Marrero Ponce, Y., Teran, J., García Jacas, C. R., Brizuela Rodríguez, C. A., & Sanchez Rodriguez, J. C. (2019). MuLiMs-MCoMPAs: A Novel Multiplatform Framework to Compute Tensor Algebra-Based Three-Dimensional Protein Descriptors. Journal of Chemical Information and Modeling. doi: 10.1021/acs.jcim.9b00629. (ID: 25457)
García Jacas, C. R., Marrero Ponce, Y., Brizuela Rodríguez, C. A., Suárez Lezcano, J., & Martinez Rios, F. (2019). Smoothed Spherical Truncation based on Fuzzy Membership Functions: Application to the Molecular Encoding. JOURNAL OF COMPUTATIONAL CHEMISTRY, 41(3), 203-217. doi: 10.1002/jcc.26089. (ID: 25402)
Valenzuela Alcaraz, V. M., Brizuela Rodríguez, C. A., Cosío León, M. Á., & Romero Ocaño, A. D. (2019, Julio). A combination of two simple decoding strategies for the no-wait job shop scheduling problem. GECCO '19: Genetic and Evolutionary Computation Conference. Praga, República Checa (ID: 25459)
Valle Peñuelas, J. L., Brizuela Rodríguez, C. A., Panduro Mendoza, M. A., & Reyna Maldonado, A. (2019, Julio). Reduction of the Number of Phase Shifters in Linear Phased Antenna Arrays by using Evolutionary Multi-Objective Optimization. 2019 IEEE International Symposium on Antennas and Propagation and USNC-URSI Radio Science Meeting. Atlanta, GA (ID: 25462)
Nava Lara, R., Aguilera Mendoza, L., Brizuela Rodríguez, C. A., Peña, A., & Del Río, G. (2019). Heterologous Machine Learning for the Identification of Antimicrobial Activity in Human-Targeted Drugs. MOLECULES, 24(1258). doi: 10.3390/molecules24071258. (ID: 25452)
Ricci López, J., Vidal Limon, A., Matias Zunñiga, V., Alderete Jimenez, J., Brizuela Rodríguez, C. A., & Aguila, S. (2019). Molecular modeling simulation studies reveal new potential inhibitors against HPV E6 protein. PLoS ONE. doi: 10.1371/journal.pone.0213028. (ID: 25450)
Romero Ocaño, A. D., Brizuela Rodríguez, C. A., Valenzuela Alcaraz, V. M., & Cosío León, M. Á. (2019). Comparación de los algoritmos NSGA-II y MOEA/D en la solución del problema de rutas de vehículos eléctricos con ventanas de tiempo y estaciones de recarga. In M. López Acosta, M. Cedillo Campos, J. Velarde Cantú, A. Bueno Solano, E. Lagarda Leyva (Eds.), Gestión en la Cadena de Suministro: Aplicaciones en Latinoamérica (pp. 17-34). Pearson. (ID: 26544)
Brizuela Rodríguez, C. A. (2018, Octubre). Companion of the NSGA II and MOEA / D for solving the Electric Fleet Size and Mix Vehicle Routing Problem with Time Windows and Recharging Stations. International Congress on Logistics & Supply Chain (CiLOG). Ciudad de México, México (ID: 24717)
Martínez Trujillo, R. M., Brizuela Rodríguez, C. A., & Márquez Martínez, L. A. (2018, Octubre). Comparación de dos técnicas evolutivas para la sintonización de PIDs en sistemas con retardo. Congreso Nacional de Control Automático. San Luis Potosí, México (ID: 24025)
Beltrán Verdugo, J. A., Aguilera Mendoza, L., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2018). Optimal selection of molecular descriptors for antimicrobial peptides classification: An evolutionary feature weighting approach. BMC GENOMICS, 19(7), 672. doi: 10.1186/s12864-018-5030-1. (ID: 23884)
Juárez Jiménez, J. A., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2018, Julio). A multi-objective formulation of the team formation problem in social networks: preliminary results. Genetic and Evolutionary Computation Conference, GECCO 2018. Kyoto, Japón (ID: 24718)
von Lucken, C., Brizuela Rodríguez, C. A., & Barán Cegla, B. (2018). An overview on evolutionary algorithms for many-objective optimization problems. Wiley Interdisciplinary Reviews: Data Mining and Knowledge Discovery. doi: 10.1002/widm.1267. (ID: 23748)
Zatarain Aceves, H., Fernández Zepeda, J. A., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2018). The Maximum Uniform Message Distribution Problem. IEEE Access. doi: 10.1109/ACCESS.2018.2837624. (ID: 23687)
Juárez Jiménez, J. A., Brizuela Rodríguez, C. A., & Martínez Pérez, I. M. (2018). An Evolutionary Multi-objective Optimization Algorithm for the Routing of Droplets in Digital Microfluidic Biochips. Information Sciences, 429, 130-146. (ID: 23019)
Colbes Sanabria, J. D., Brizuela Rodríguez, C. A., & Aguila, S. (2018). Scoring of Side-Chain Packings: An Analysis of Weight Factors and Molecular Dynamics Structures. Journal of Chemical Information and Modeling, 58(2), 443-452. doi: 10.1021/acs.jcim.7b00679. (ID: 23688)
Brizuela Rodríguez, C. A. (2017, Noviembre). ¿Empaquetamiento de la cadena lateral en proteínas: Un enfoque computacional¿. Doscientos años después de la descripción de Parkinson. Mal plegamiento de proteínas y enfermedades Neurodegenerativas. Ciudad de México, México (ID: 23023)
Beltrán Verdugo, J. A., Aguilera Mendoza, L., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2017, Noviembre). Feature weighting for antimicrobial peptides classification: A multi-objective evolutionary approach. 2017 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM). Kansas City, MO (ID: 23022)
Corral Corral, R., Beltrán Verdugo, J. A., Brizuela Rodríguez, C. A., & Del Río, G. (2017). Systematic identification of machine-learning models aimed to classify critical residues for protein function from protein structure. MOLECULES, 22(10), 1673. doi: 10.3390/molecules22101673. (ID: 23018)
Garza Moreno, J. C., Panduro Mendoza, M. A., Reyna Maldonado, A., Covarrubias Rosales, D. H., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2017). Synthesis of a Scannable Pattern for 3D Cubic Antenna Arrays. IETE TECHNICAL REVIEW. doi: 10.1080/02564602.2017.1347073. (ID: 22527)
Guillén Ramírez, H. A., Colbes Sanabria, J. D., Brizuela Rodríguez, C. A., & Martínez Pérez, I. M. (2017, Mayo). Accurate Classification of Immunomodulatory RNA Sequences. 2017 IEEE International Joint Conference on Neural Networks. Anchorage, AK (ID: 23021)
Brizuela Rodríguez, C. A. (2016, Octubre). Algunos Desafíos Computacionales en Bioinformática de Proteínas. Enfoques computacionales para resolver problemas biológicos. Mérida, México (ID: 22196)
Colbes Sanabria, J. D., Corona de la Fuente, R. I., Lezcano Ríos, C., Rodríguez Uribe, D. O., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2016). Protein side-chain packing problem: is there still room for improvement?. BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS. doi: 10.1093/bib/bbw079. (ID: 20845)
Brizuela Rodríguez, C. A., & Beltrán Verdugo, J. A. (2016, Julio). Design of selective cationic antibacterial peptides: A multiobjective genetic algorithm approach. 2016 IEEE Congress on Evolutionary Computation (CEC). Vancouver, Canadá (ID: 22025)
Vargas Gastélum, L. B., Romero Olivares, A. L., Catalán Dibene, J., Rocha Olivares, A., Brizuela Rodríguez, C. A., Herzka Llona, S. Z., Escalante Hernández, A. E., & Riquelme Pérez, M. (2016, Junio). Unraveling fungal diversity of deep­sea sediments from the Gulf of Mexico. Gordon Research Conference on Cellular and Molecular Fungal Biology. Plymouth, NH (ID: 20755)
von Lucken, C., Brizuela Rodríguez, C. A., & Barán Cegla, B. (2016). Experimental comparison of many-objective evolutionary preference-based methods in parallel framework. Journal of Computational Interdisciplanary Sciences, 7(1), 13-20. doi: 10.6062/jcis.2016.07.01.0103. (ID: 22381)
Zatarain Aceves, H., Fernández Zepeda, J. A., Brizuela Rodríguez, C. A., & Fajardo Delgado, D. (2015). A cascade evolutionary algorithm for the bodyguard allocation problem. Applied Soft Computing, 37, 643-651. doi: 10.1016/j.asoc.2015.08.056. (ID: 19498)
Vargas Gastélum, L. B., Romero Olivares, A. L., Catalán Dibene, J., Rocha Olivares, A., Brizuela Rodríguez, C. A., Herzka Llona, S. Z., & Riquelme Pérez, M. (2015, Noviembre). Fungal diversity of deep-sea sediments from the Gulf of Mexico post Deepwater Horizon oil spill. IX Simposio Internacional del Departamento de Microbiología: Métodos emergentes de diagnóstico y tratamiento de enfermedades crónicas e infecciosas. Ensenada, México (ID: 20136)
Hernández Ayón, S. E., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2015, Noviembre). Designing rotamer libraries based on pairs of consecutive residues: A preliminary analysis. 2015 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine. Bethesda, MD (ID: 20081)
von Lucken, C., Monzón, H., Brizuela Rodríguez, C. A., & Barán Cegla, B. (2015, Julio). Dimensionality Reduction in Many-objective Problems Combining PCA and Spectral Clustering. 2015 Annual Conference on Genetic and Evolutionary Computation. Madrid, España (ID: 20092)
Brizuela Rodríguez, C. A., Corona de la Fuente, R. I., Lezcano Ríos, C., Rodríguez Uribe, D. O., & Colbes Sanabria, J. D. (2015, Julio). An Experimental Analysis of the Performance of Side Chain Packing Algorithms. 2015 Annual Conference on Genetic and Evolutionary Computation. Madrid, España (ID: 20088)
Vargas Gastélum, L. B., Romero Olivares, A. L., Escalante Hernández, A. E., Rocha Olivares, A., Brizuela Rodríguez, C. A., & Riquelme Pérez, M. (2015). Impact of seasonal changes on fungal diversity of a semi-arid ecosystem revealed by 454 pyrosequencing. FEMS Microbiology Ecology, 91(5), 13. doi: 10.1093/femsec/fiv044. (ID: 19079)
von Lucken, C., Brizuela Rodríguez, C. A., & Barán Cegla, B. (2015, Marzo). Clustering Based Parallel Many-Objective Evolutionary Algorithms Using the Shape of the Objective Vectors. 8th International Conference on Evolutionary Multiobjective Optimization. Guimarães, Portugal (ID: 20089)
Vargas Gastélum, L. B., Romero Olivares, A. L., Escalante Hernández, A. E., Brizuela Rodríguez, C. A., Rocha Olivares, A., & Riquelme Pérez, M. (2015, Marzo). Fungal diversity associated to microhabitat variation revealed by 454 pyrosequencing in a semiarid ecosystem in Baja California, Mexico, endemic for Valley Fever. 28th Fungal Genetics Conference. Pacific Grove, CA (ID: 20135)
Mendoza, C., Szarán, E., Pinto Roa, D., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2015, Febrero). Ruteo de Micro-fluidos en Biochips Digitales: Un enfoque basado en Colonia de Hormigas. X Congreso Español sobre Metaheurísticas, Algoritmos Evolutivos y Bioinspirados. Mérida, España (ID: 20090)
Pinto Roa, D., Brizuela Rodríguez, C. A., & Barán Cegla, B. (2014). Multi-objective routing and wavelength converter allocation under uncertain traffic. Optical Switching and Networking. doi: 10.1016/j.osn.2014.10.001. (ID: 17807)
García Nájera, A., Brizuela Rodríguez, C. A., & Martínez Pérez, I. M. (2014). An efficient genetic algorithm for setup time minimization in PCB assembly. INTERNATIONAL JOURNAL OF ADVANCED MANUFACTURING TECHNOLOGY. doi: 10.1007/s00170-014-6510-3. (ID: 17805)
Juárez Jiménez, J. A., Brizuela Rodríguez, C. A., Martínez Pérez, I. M., Velázquez Sánchez, A. K., & Lozano Guzmán, E. L. (2014, Octubre). A genetic algorithm for the routing of droplets in DMFB: Preliminary results. 2014 IEEE International Conference on Systems, Man and Cybernetics. San Diego, CA (ID: 17809)
Flores Granados, D. I., Sotelo Mundo, R., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2014). A simple extension to the CMASA method for the prediction of catalytic residues in the presence of single point mutations. PLoS ONE, 9(9), e108513. doi: 10.1371/journal.pone.0108513. (ID: 17227)
López Monzalvo, F., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2014). An experimental analysis of the p-Median problem under uncertainty: an evolutionary algorithm approach. European Journal of Industrial Engineering, 8(4), 554-578. doi: 10.1504/EJIE.2014.064759. (ID: 16526)
von Lucken, C., Barán Cegla, B., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2014). A survey on multi-objective evolutionary algorithms for many-objective problems. COMPUTATIONAL OPTIMIZATION AND APPLICATIONS, 58(3), 707-756. doi: 10.1007/s10589-014-9644-1. (ID: 17806)
Cervantes Salido, V. M., Jaime Solis, O., Brizuela Rodríguez, C. A., & Martínez Pérez, I. M. (2013). Improving the design of sequences for DNA computing: a multiobjective evolutionary approach. Applied Soft Computing, 13(12), 4594-4607. doi: 10.1016/j.asoc.2013.06.010. (ID: 15863)
Vargas Gastélum, L. B., Escalante Hernández, A. E., Rocha Olivares, A., Brizuela Rodríguez, C. A., & Riquelme Pérez, M. (2013, Noviembre). Changes in soil fungal diversity associated to seasonal variations revealed by 454 pyrosequencing in a semi-arid ecosystem in Baja California, México. Microbes in Biomedical and Ecological Research Symposium. Ensenada, México (ID: 14378)
Watkinson Medina, N. D., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2013, Noviembre). Selección de características para análisis de sentimientos basado en computación evolutiva: resultados preliminares. 6to. Congreso Internacional en Ciencias Computacionales. Ensenada, México (ID: 17106)
Brizuela Rodríguez, C. A., Luna Taylor, J. E., Martínez Pérez, I. M., Guillén Ramírez, H. A., Rodríguez Uribe, D. O., & Beltrán Verdugo, J. A. (2013, Junio). Improving an evolutionary multi-objective algorithm for the biclustering of gene expression data. 2013 IEEE Congress on Evolutionary Computation (CEC). Cancún, México (ID: 16587)
Panduro Mendoza, M. A., Brizuela Rodríguez, C. A., Garza Moreno, J. C., Hinojosa Álvarez, S. J., & Reyna Maldonado, A. (2013). A comparison of NSGA-II, DEMO, and EM-MOPSO for the multi-objective design of concentric, rings antenna arrays. Journal of Electromagnetic Waves and Applications, 27(9), 1100-1113. doi: 10.1080/09205071.2013.801040. (ID: 16341)
Pinto Roa, D., Barán Cegla, B., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2013, Mayo). A multi-objective approach for routing and wavelength converter allocation under uncertainty. 20th International Conference on Telecomunications. Casablanca, Marruecos (ID: 16927)
Luna Taylor, J. E., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2012, Marzo). Algoritmo genético multi-objetivo biclustering para el análisis de datos de expresión de genes. 3rd International Supercomputing Conference in Mexico (ISUM 2012). Guanajuato, México (ID: 14317)
López Miranda, C. A., Brizuela Rodríguez, C. A., & Covarrubias Rosales, D. H. (2012, Febrero). Algoritmo genético estocástico modificado (StGA2) aplicado a comunicaciones móviles. VIII Congreso Español de Metaheurísticas, Algoritmos Evolutivos y Bioinspirados. Albacete, España (ID: 16392)
Gutiérrez López, E., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2011). An enhanced MOGWW for the bi-objetctive quadratic assignment problem. International Journal of Computational Intelligence Systems, 4(4), 530-549. doi: 10.2991/ijcis.2011.4.4.12. (ID: 12532)
Pinto Roa, D., Barán Cegla, B., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2011). Routing and wavelength converter allocation in WDM networks: a multi-objective evolutionary optimization approach. Photonic Network Communications. doi: 10.1007/s11107-011-0304-4. (ID: 12466)
Márquez Martínez, L. A., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2010, Junio). Efficient inversion of matrices over a non-commutative ring. 9th IFAC Workshop on Time Delay Systems. Praga, República Checa (ID: 12270)
Pinto Roa, D., Barán Cegla, B., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2009, Noviembre). Wavelength converter allocation in optical networks: an evolutionary multi-objective optimization approach. 9th International Conference on Intelligent Systems Design and Applications. Pisa, Italia (ID: 13799)
Maciel, R., Sobrino, M., Pinto Roa, D., Barán Cegla, B., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2009, Septiembre). Optimal wavelength converter allocation: A new approach based MOEA. 5th Latin American Networking Conference 2009. Pelotas, Brasil (ID: 13800)
Panduro Mendoza, M. A., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2009, Junio). A comparative analysis of the performance of GA, PSO and DE for circular antenna arrays. IEEE International Symposium on Antennas & Propagation. Charleston, SC (ID: 13597)
Palacios Alonso, M. A., Brizuela Rodríguez, C. A., & Sucar Succar, L. E. (2009). Evolutionary learning of dynamic naive bayesian classifiers. Journal of Automated Reasoning. doi: 10.1007/s10817-009-9130-0. (ID: 13596)
Panduro Mendoza, M. A., Brizuela Rodríguez, C. A., Balderas, L. I., & Acosta, D. A. (2009). A comparison of genetic algorithms, particle swarm optimization and the differential evolution method for the design of scannable circular antenna arrays. Progress In Electromagnetics Research B, 13, 171-186. doi: 10.2528/PIERB09011308. (ID: 13595) (E)
Chernykh, A., Trystram, D., Brizuela Rodríguez, C. A., & Scherson, I. (2009). Idle regulation in non-clairvoyant scheduling of parallel jobs. Discrete Applied Mathematics, 157(2), 369-376. doi: 10.1016/j.dam.2008.03.005. (ID: 13183)
García Nájera, A., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2008, Diciembre). An efficient genetic algorithm for setup time minimization in PCB Assembly. VI ALIO/EURO Workshop on Applied Combinatorial Optimization. Buenos Aires*, Argentina (ID: 9845)
Palacios Alonso, M. A., Brizuela Rodríguez, C. A., & Sucar Succar, L. E. (2008, Mayo). Evolutionary learning of dynamic naive bayesian classifiers. 21st International FLAIRS Conference. Coconut Grove, FL (ID: 9926)
Panduro Mendoza, M. A., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2008). Evolutionary multi-objective design of non-uniform circular phased arrays. COMPEL: The international journal for computation and mathematics in electrical and electronic engineering, 27(2), 551-566. doi: 10.1108/03321640810847823. (ID: 11588)
Panduro Mendoza, M. A., Brizuela Rodríguez, C. A., & Covarrubias Rosales, D. H. (2008). Design of electronically steerable linear arrays with evolutionary algorithms. Applied Soft Computing, 8(1), 46-54. doi: 10.1016//j.asoc.2006.10.011. (ID: 9229)
Gutiérrez López, E., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2007, Octubre). An experimental study of the multi-objective go with the winners algorithm on the biobjective QAP with correlated flow matrices. 2007 International Conference on Systems, Man and Cybernetics. Montreal, Canadá (ID: 9844)
Brizuela Rodríguez, C. A., & Luhrs Olmos, E. (2007, Octubre). A team of genetic algorithms for the multiple sequence alignment problem: Preliminary Results. 2007 IEEE International Conference on Systems, Man and Cybernetics. Montreal, Canadá (ID: 9843)
Martínez Arellano, G., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2007, Octubre). An enhanced genetic algorithm for the motif finding problems. Tercer Congreso Meixcano de Computación Evolutiva (COMCEV 07). Aguascalientes, México (ID: 11616)
Brizuela Rodríguez, C. A., Rodríguez Zambrano, M., & Luna Taylor, J. E. (2007). Evolutionary computation techniques for two computational biology problems. In G. Romero, A. Méndez, M. Panduro and R. Domínguez. (Eds.), New Trends in Electronics Technology (pp. 111-118). Innovación Editorial Lagares. (ID: 11615)
Martínez Arellano, G., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2007, Agosto). Comparison of simple encoding schemes in GA's for the motif finding problem: Preliminary results. Second Brazilian Symposium on Bioinformatics BSB 2007. Angra dos Reis, Brasil (ID: 11408)
Brizuela Rodríguez, C. A., González Gurrola, L. C., Chernykh, A., & Trystram, D. (2007). Sequencing by hybridization: an enhanced crossover operator for a hybrid genetic algorithm. Journal of Heuristics, 13(3), 209-225. doi: 10.1007/S10732-007-9014-6. (ID: 11890)
Rocha Alicano, C. R., Covarrubias Rosales, D. H., Brizuela Rodríguez, C. A., & Panduro Mendoza, M. A. (2007). Differential evolution algorithm applied to sidelobe level reduction on a planar array. AEU - International Journal of Electronics and Communications, 61(5), 286-290. doi: 10.1016/j.aeue.2006.05.008. (ID: 7877)
Gutiérrez López, E., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2006, Noviembre). ILS-perturbation based on local optima structure for the QAP problem. 5th Mexican International Conference on Artificial Intelligence. Apizaco, México (ID: 11530)
Brizuela Rodríguez, C. A. (2006, Octubre). Técnicas de cómputo evolutivo para biología computacional. 2a. Semana de Ingeniería Electrónica y Electromecánica. Ensenada, México (ID: 11531)
Brizuela Rodríguez, C. A., Rodríguez Zambrano, M., & Luna Taylor, J. E. (2006, Septiembre). Técnicas de cómputo evolutivo para biología computacional. Primer Simposio Internacional en Electrónica y Tecnologías de la Información SIETI-06. Reynosa, México (ID: 8501)
Rocha Alicano, C. R., Covarrubias Rosales, D. H., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2006, Julio). Performance evaluation of two array factor synthesis techniques for steerable linear arrays. Third IASTED International Conference on Antennas, Radar and Wave Propagation. Banff, Canadá (ID: 9631)
Zola, J., Trystram, D., Chernykh, A., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2006, Abril). Parallel multiple sequence alignment with local phylogeny search by simulated annealing. 20th IEEE International Parallel & Distributed Processing Symposium. Rodas, Grecia (ID: 7943)
Panduro Mendoza, M. A., Brizuela Rodríguez, C. A., Covarrubias Rosales, D. H., & López Miranda, C. A. (2006). A trade-off curve computation for linear antenna arrays using an evolutionary multi-objective approach. Soft Computing, 10, 125-131. (ID: 8259)
Romero González, H. J., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2005, Septiembre). DNA sequencing by hybridization: A set of probably solvable instances. Sexto Encuentro Internacional de Computación ENC '05. Puebla, México (ID: 9706)
Gutiérrez López, E., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2005, Septiembre). Introducing LS interaction for problems having the "Big Valley" structure. Sexto Encuentro Internacional de Computación ENC' 05. Puebla, México (ID: 8667)
García Nájera, A., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2005, Septiembre). PCB Assembly: An efficient genetic algorithm for slot assignment and component pick and place sequence problems. 2005 IEEE Congress on Evolutionary Computation. Edimburgo, Escocia (ID: 9240)
Panduro Mendoza, M. A., Covarrubias Rosales, D. H., Brizuela Rodríguez, C. A., & Marante Rizo, F. R. (2005). A multi-objective approach in the linear antenna array design. AEU - International Journal of Electronics and Communications, 59(4), 205-212. (ID: 5214)
Brizuela Rodríguez, C. A., & Gutiérrez López, E. (2005, Marzo). Multi-objective go with the winners algorithm: A preliminary study. Third International Conference on Evolutionary Multi-Criterion Optimization. Guanajuato, México (ID: 9673)
González Gurrola, L. C., Brizuela Rodríguez, C. A., & Gutiérrez López, E. (2004, Noviembre). A genetic algorithm for the shortest common superstring problem. Advances in Artificial Intelligence - IBERAMIA 2004. Puebla, México (ID: 7655)
Rabelo, D., Covarrubias Rosales, D. H., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2004, Octubre). Estimación de la dirección de arribo en comunicaciones móviles aplicando algoritmos genéticos. XXXVII Congreso Nacional de la Sociedad Matemática Mexicana. Ensenada, México (ID: 8858)
Brizuela Rodríguez, C. A. (2004, Octubre). Optimización combinatoria en el mundo real. XXXVII Congreso Nacional de la Sociedad Matemática Mexicana. Ensenada, México (ID: 9538)
González Gurrola, L. C., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2004, Septiembre). Experimental analysis of a genetic algorithm for the sequencing by hybridization problem. Quinto Encuentro Internacional de Computación ENC '04. Colima, México (ID: 9243)
Romero González, H. J., Brizuela Rodríguez, C. A., & Chernykh, A. (2004, Septiembre). An experimental comparison of two approximation algorithms for the shortest common superstring problem. Fifth Mexican International Conference in Computer Science. Colima, México (ID: 7657)
Mendez Perez, A. L., Covarrubias Rosales, D. H., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2004, Septiembre). Perfomance evaluation of the CDMA/GPS-DW model for multimedia traffic considering a preemptive priority scheme. 15th International Symposium on Personal, Indoor and Mobile Radio Communications. Barcelona*, España (ID: 9446)
Méndez Pérez, A. L., Covarrubias Rosales, D. H., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2004). Fair scheduling with dynamic resource allocation in CDMA/GPS system for IP-multimedia wireless networks. Journal of Circuits, Systems and Computers, 13(2), 253-269. (ID: 6192)
González Gurrola, L. C., Romero González, H. J., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2004, Junio). A genetic algorithm for the shortest common superstring problem. Genetic and Evolutionary Computation - GECCO 2004. Seattle, WA (ID: 7660)
Brizuela Rodríguez, C. A., González Gurrola, L. C., & Romero González, H. J. (2004, Abril). An improved genetic algorithm for the sequencing by hybridization problem. Aplications of Evolutionary Computing, Workshops. Coimbra, Portugal (ID: 9541)
Aceves Pérez, R., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2003, Mayo). Análisis experimental de operadores genéticos en NSGA-II para un problema de calendarización multi-objetivo. Primer Congreso Mexicano de Computación Evolutiva. Guanajuato, México (ID: 7001)
Gutiérrez López, E., & Brizuela Rodríguez, C. A. (2003, Mayo). Comparación experimental de operadores de cruzamiento para el problema de localización de radio bases en redes celulares. Primer Congreso Mexicano de Computación Evolutiva. Guanajuato, México (ID: 7000)
Brizuela Rodríguez, C. A., & Gutiérrez López, E. (2003, Abril). An experimental comparison of two different encoding schemes for the location of base stations in cellular networks. The 3rd European Workshop on Evolutionary Computation in Combinatorial Optimization. Essex, Inglaterra (ID: 7002)
Brizuela Rodríguez, C. A., & Aceves Pérez, R. (2003, Abril). Experimental genetic operators analysis for the multi-objective permutation flowshop. Second International Conference, Evolutionary Multi-Criterion Optimization. Faro, Portugal (ID: 7003)
Brizuela Rodríguez, C. A., & Sannomiya, N. (2001). Robustness and diversity in genetic algorithms for a complex combinatorial optimization problem. International Journal of Systems Science, 32(9), 1161-1168. (ID: 9242) (E)
Brizuela Rodríguez, C. A., Zhao, Y., & Sannomiya, N. (2001, Octubre). No-wait and blocking job-shops: Challenging problems for GA¿s. IEEE Conference Proceedings. Tucson, AZ (ID: 5298)

Líneas de Investigación e Incidencia Social

Algoritmos y Biocomputación

Biología computacional y computación biológica

Proyectos

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Tesis Dirigidas
TítuloEstudianteFecha
Algoritmos para el diseño computacional de péptidos estructuradosYan Carlos Leyva Labrador18-09-2024
Búsqueda de un conjunto óptimo de descriptores moleculares para la modelación QSARLuis Antonio García González06-12-2023
Control de sistemas usando aprendizaje de máquinaJesús Martín Miguel Martínez02-10-2023
Virtual screening using machine learning techniques and ensemble docking-based molecular descriptorsJoel Ricci López02-10-2023
Una propuesta de agregación de nodos basada en la integral discreta de Choquet para la clasificación de grafos utilizando RNGsHugo Daniel Sarmiento Rodríguez03-08-2023
Problema de enrutamiento de vehículos con enfoque verde y flota mixtaHéctor Jahir Sandoval Chávez28-06-2023
Problemas de formación de equipoJulio Antonio Juárez Jiménez11-02-2022
Implementación de algoritmos de clasificación de una sola clase para la clasificación de péptidos antimicrobianosIsaac Pedro Tapia Contreras02-02-2022
Clasificación multiclase de péptidos antimicrobianos: un enfoque comparativoSergio Alejandro Pinacho Castellanos15-01-2021
Modelo descriptivo basado en redes de similitud molecular para el análisis visual de un espacio químico-biológico de péptidos bioactivosLongendri Aguilera Mendoza13-10-2020
Predicción de regiones de cromatina abierta a partir del perfil de activación de la histona H3K27acCésar Miguel Valdez Córdova27-02-2020
Diseño óptimo de arreglos de antenas lineales en fase con subarreglosJuan Luis Valle Peñuelas17-01-2020
Aprendizaje de máquina para la identificación de péptidos inductores de autofagiaKaren Guerrero Vázquez07-10-2019
Análisis del desempeño de herramientas de acoplamiento molecular para el estudio de interacciones proteína-péptidoOsvel Chávez Hernández04-10-2019
Métodos de selección óptima de descriptores moleculares para la clasificación de la actividad antimicrobiana y el diseño de nuevos péptidosJesús Armando Beltrán Verdugo01-07-2019
Algoritmos bioinspirados para la sintonización de sistemas de control con retardoRené Míchel Martínez Trujillo01-11-2018
Diseño de algoritmos para resolver el problema de distribución máxima y homogénea de mensajesHéctor Zatarain Aceves06-09-2018
Análisis de documentos de opinión usando la representación word2vecAntonio de Jesús García Chávez30-07-2018
Evaluación y diseño de predictores de interacción miARN-proteínaNephtali Dicochea Moreno09-07-2018
Empacamiento de la cadena lateral de proteínas: algoritmos, límites del desempeño y funciones de calificaciónJosé Domingo Colbes Sanabria14-06-2018
Análisis de transcriptomas para el descubrimiento de péptidos antimicrobianosGermán Meléndrez Carballo26-02-2018
Estudio in silico del genoma del virus de la hepatitis C para buscar su interrupción viral mediante la identificación de fármacos candidatosVíctor Hugo Vargas Bermúdez17-01-2018
Estudio in silico de la proteína E6 del virus del papiloma humano para identificar potenciales fármacos antiviralesJoel Ricci López28-11-2017
Identificación in silico de sitios catalíticos en estructuras tridimensionales de proteínasDavid Israel Flores Granados27-02-2015
Diseño de algoritmos para el problema de coordinación de movimiento de múltiples robots a lo largo de trayectorias pre-especificadasJulio Antonio Juárez Jiménez20-02-2015
Laboratorios