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Dirección de Estudios de Posgrado

Biotecnología y Genómica de Organismos Acuáticos

Los proyectos desarrollados en esta LGAC se basan principalmente en el uso de herramientas y técnicas de última generación enfocadas en diferentes áreas de aplicación. A través de la caracterización molecular y de la identificación filogenética, se realiza la bioprospección y el estudio de la biodiversidad de organismos acuáticos; se investigan los mecanismos moleculares de la expresión genética, y se desarrollan microorganismos recombinantes sobreproductores de metabolitos bioactivos, fundamentales para la obtención de compuestos de alto valor agregado de importancia biotecnología e industrial.

  • Díaz Herrera Fernando
  • Durán Riveroll Lorena María
  • Galindo Sánchez Clara Elizabeth
  • Lizárraga Partida Marcial Leonardo
  • Olmos Soto Jorge
  • Ponce Rivas Elizabeth
  • Re Araujo Ana Denise
  • Sánchez Castrejón Edna

  • Chavez Solis , E., Mascaro Miquelajauregui, M., Rosas Vazquez, C., Rodriguez Fuentes, G., Caamal Monsreal, C., Paschke Lamana, K., Díaz Herrera, F., & Re Araujo, A. D. (2024). Are haloclines distributional barriers in anchialine ecosystems? Physiological response of cave shrimps to salinity. PLoS ONE, 19(7), e0305909. doi: 10.1371/journal.pone.0305909. (ID: 29754)
  • Martínez Mercado, M. A., Cembella, A. D., Sánchez Castrejón, E., Saavedra Flores, A., Galindo Sánchez, C. E., & Durán Riveroll, L. M. (2024). Functional diversity of bacterial microbiota associated with the toxigenic benthic dinoflagellate Prorocentrum. PLoS ONE, 19(7), 22. doi: 10.1371/journal.pone.0306108. (ID: 29795)
  • Ángeles González , L. E., Torrejón Magallanes, E. J., Escamilla Ake, A., Osorio Olvera, L., Avendaño, O., Díaz Herrera, F., & Rosas Vazquez, C. (2024). Can upwelling regions be potential thermal refugia for marine fishes during climate warming?. Journal of Thermal Biology, 123, 103893. doi: 10.1016/j.jtherbio.2024.103893. (ID: 29728)
  • Ramos Mendoza, I. S., Embarcadero Jiménez, S., Barrios Navarro, A. F., Ledezma González, D. C., Lago Lestón, M. A., Valenzuela- Suárez, B. J., Ramírez Alvarez, N., & Silva Jiménez, H. (2024). Prokaryotic community structure and predicted metabolism associated with hydrocarbon degradation in marine sediments from the Northwest Coast of Baja California, Mexico. JOURNAL OF SOILS AND SEDIMENTS, 24, 3148-3166. doi: 10.1007/s11368-024-03822-w. (ID: 29743)
  • Pacheco Sandoval, A. M., Schramm Urrutia , Y., Heckel Dziendzielewski, G., Giffard Mena, I., & Lago Lestón, M. A. (2024). Unraveling the gut microbiota of Mexican pinnipeds: the dominance of life histories over phylogeny. Applied and Environmental Microbiology, 90(6), e0203023. doi: 10.1128/aem.02030-23. (ID: 29742)
  • Meza Buendia, A. K., Aparicio Trejo , O. E., Díaz Herrera, F., Pedraza Chaverri, J., Álvarez Delgado, C., & Rosas Vazquez, C. (2024). Climate change consequences on the systemic heart of female Octopus maya: oxidative phosphorylation assessment and the antioxidant system. Biology Open, 13(5), bio060103. doi: 10.1242/bio.060103. (ID: 29702)
  • Zepeda Lupio, E. G., Garcia Esquivel, Z., Gonzalez Gomez , M., Díaz Herrera, F., & Castellanos Martinez, S. (2024). Clearance rates of sand-burrowed and laterally pressed unburrowed Pismo clam Tivela stultorum (Mawe 1823) in a laboratory open-flow system. Biology Open, 13(4), bio060268. doi: 10.1242/bio.060268. (ID: 29703)
  • Okolodkov, Y. B., Cervantes Urieta, V. A., Aguilar Trujillo, A. C., Merino Virgilio, F. C., Cruz Trejo , G., Huerta Quintanilla , D. A., Steidinger, K., Gárate Lizárraga, I., Durán Riveroll, L. M., & Herrera Silveira, J. (2024). Durinskia yucatanensis sp. nov. (Peridiniales: Kryptoperidiniaceae), a new planktonic dinoflagellate species, and its habitat in coastal Yucatan waters, Gulf of Mexico. Hidrobiológica, 34(1), 12. doi: 10.24275/LSHU4081. (ID: 29665)
  • Juárez Valdez, O. E., Morales Guerrero, B., Liñán Cabello, M. A., Carpizo Ituarte, E., Delgadillo Nuño, E., Delgadillo Nuño, M. A., Gomez Reyes, R., Ventura López, C., Cabral Tena, R. A., & Galindo Sánchez, C. E. (2024). Transcriptome characterization of Pocillopora grandis transplanted into reefs with different health conditions: potential stress indicators at the holobiont level. Latin American Journal of Aquatic Research, 52(1), 119-149. https://doi.org/10.3856/vol52-issue1-fulltext-2991. (ID: 29775)
  • Sánchez Ovando, J. P., Re Araujo, A. D., Díaz Herrera, F., Iñiguez Pacheco, J. E., Norzagaray Lopez, O., & Vinn, O. (2024). Microstructure and mineralogy of the tube and operculum of serpulid polychaetes from temperate and warm waters. ZOOMORPHOLOGY. doi: 10.1007/s00435-023-00637-0. (ID: 29577)
  • Paniagua Michel, J. J., & Banat, M. I. (2024). Unravelling Diatoms Potential for the Bioremediation of Oil Hydrocarbons in Marine Environments. Clean Technologies, 6, 93-115. doi: 10.3390/Cleantechnol6010007. (ID: 29557)
  • Giffard Mena, I., Ponce Rivas, E., Sigala Andrade, H. M., Uranga Solis, C. C., Re Araujo, A. D., Díaz Herrera, F., & Camacho Jiménez, L. (2024). Evaluation of the osmoregulatory capacity and three stress biomarkers in white shrimp Penaeus vannamei exposed to different temperature and salinity conditions: Na+/K+ ATPase, Heat Shock Proteins (HSP), and Crustacean Hyperglycemic Hormones (CHHs). Comparative Biochemistry and Physiology Part B: Biochemistry and Molecular Biology, 110942. doi: 10.1016/j.cbpb.2024.110942. (ID: 29619)
  • Valenzuela Gutiérrez, R. A., Lago Lestón, M. A., Cicala, F., Hernández Rodríguez, M., Barón Sevilla, B., Armuelles Bernal, C. E., Vargas Albores, F., Garibay Valdez, E., Gomez Reyes, R., & Martínez Porchas, M. (2023). Garlic (Allium sativum) as a dietary ingredient can cause dysbiosis in the microbiota of the California yellowtail (Seriola dorsalis) at high concentrations. Aquaculture International. doi: 10.1007/s10499-023-01301-6. (ID: 28967)
  • Alvarez Lee, L., Re Araujo, A. D., Díaz Herrera, F., Sanchez Ovando , J. P., & Pérez Carrasco, L. (2023). Thermal biology and plasticity of the thermal metabolic scope of angelfish Pterophyllum scalare acclimated to different temperatures. International Aquatic Research, 15, 263-269. doi: 10.22034/IAR.2023.1985934.1441. (ID: 28909)
  • Ponce Vélez, M. G., Lago Reynoso, F., Castañeda Chávez, M. R., Marcovecchio, J., Lizárraga Partida, M. L., Vázquez Botello, A., Arias, A., Horta Puga, G., Briones Venegas, A. N., & Rendón Lugo, A. N. (2023). Acciones de prevención y reducción de la contaminación marina. In Rivera-Arriaga E., Azuz Adeath I. (Eds.), La década del océano en México 2021-2030: La ciencia que necesitamos (pp. 29-53). Universidad Autónoma de Campeche. (ID: 28871)
  • Gomez Reyes, R., Galindo Sánchez, C. E., Lafarga de la Cruz, F., Hernandez Ayon, J. M., Valenzuela Wood, E., & Lopez Galindo, L. L. (2023). Individual Pattern Response to CO2-Induced Acidification Stress in Haliotis rufescens Suggests Stage-Specific Acclimatization during Its Early Life History. Sustainability, 15(14010), 18. doi: 10.3390/su151814010. (ID: 29331)
  • Gasca Pineda, J., Galindo Sánchez, C. E., Martínez Mercado, M. A., Jiménez Rosemberg, P., Hereu Romero, C. M., Nakamura, Y., Herzka Llona, S. Z., Compairé, J. C., Gómez Reyes, R. J. E., Flores Robles, J., Saavedra Flores, A., & Arteaga Uribe, M. C. (2023). Community structure and diversity of five groups of zooplankton in the Perdido region of the Gulf of Mexico using DNA metabarcoding. AQUATIC ECOLOGY. doi: 10.1007/s10452-022-10002-w. (ID: 28856)
  • Ángeles González, L. E., Re Araujo, A. D., Díaz Herrera, F., Caamal Monsreal, C., Rodriguez Fuentes, G., Galindo Sánchez, C. E., Mascaro Miquelajauregui, M., Pascual, C., & Rosas Vazquez, C. (2023). Thermal optimality and physiological parameters inferred from experimental studies scale latitudinally with marine species occurrences. Journal of Thermal Biology, 114, 103495. doi: 10.1016/j.jtherbio.2023.103495. (ID: 28798)
  • Durán Riveroll, L. M., Juárez Valdez, O. E., Okolodkov, Y. B., Mejía Camacho, A. L., Ramírez Corona, F., Casanova Gracia, D., Osorio Ramírez, M. C., Cervantes Urieta, V. A., & Cembella, A. D. (2023). Morphological and Molecular Characterization of the Benthic Dinoflagellate Amphidinium from CoastalWaters of Mexico. Phycology, 3(1), 305-324. doi: 10.3390/phycology3020020. (ID: 28849)
  • Mroue Ruiz, F., Pacheco Sandoval, A. M., Lago Lestón, M. A., Giffard Mena, I., Abadía Cardoso , A., Chong Robles, J., & Schramm Urrutia , Y. (2023). Metabarcoding Used for the First Time to Identify Prey of Wild Totoaba macdonaldi. INTEGRATIVE AND COMPARATIVE BIOLOGY, 63(2), 276-287. doi: 10.1093/icb/icad030. (ID: 29444)
  • Lopez Galindo, L. L., Larios Soriano, E., Ventura López, C., Díaz Herrera, F., Re Araujo, A. D., & Galindo Sánchez, C. E. (2023). Eyestalk ablation and acclimation temperatures affect juveniles Penaeus vannamei thermo-tolerance: molecular biomarkers of cell protection oxidative stress, and compensatory mechanisms. Latin American Journal of Aquatic Research, 51(2), 295-308. doi: 10.3856/vol51-issue2-fulltext-2926. (ID: 28865)
  • Balderas González, V. Y., Ponce Rivas, E., Díaz Herrera, F., Camacho Jiménez, L., Sánchez Castrejón, E., & Aguilar, M. B. (2023). Metabolic and osmoionic effects of the recombinant crustacean hyperglycemic hormone (rCHH-A) of the Pacific white shrimp Penaeus vannamei on specimens acutely exposed to extreme salinities. Latin American Journal of Aquatic Research, 51(2), 248-267. doi: 10.3856/vol51-issue2-fulltext-2967. (ID: 28440)
  • Dominguez Castanedo, O., Palomino Cruz, D., Mascaro Miquelajauregui, M., Rodriguez Fuentes, G., Juárez Valdez, O. E., Galindo Sánchez, C. E., Caamal Monsreal, C., Galindo Torres, P., Díaz Herrera, F., & Rosas Vazquez, C. (2023). Trans-generational physiological condition of embryos is conditioned by maternal thermal stress in Octopus maya. Marine Biology, 170(41), 1-14. doi: 10.1007/s00227-023-04183-7. (ID: 28731)
  • Larios Soriano, E., Díaz Herrera, F., Re Araujo, A. D., Lopez Acuña, L., Lopez Galindo, L. L., True, C. D., Alvarez, C. A., & Galaviz Espinoza, M. A. (2023). Influence of temperature on respiratory metabolism during early development of Totoaba macdonaldi. Latin American Journal of Aquatic Research, 51(1), 109-116. doi: 10.3856/vol51-issue1-fulltext-2952. (ID: 28732)
  • Durán Riveroll, L. M., Weber, J., & Krock, B. (2023). First Identification of Amphidinols from Mexican Strains and New Analogs. Toxins, 15(163), 1-18. doi: 10.3390/toxins15020163. (ID: 28683)

  • Efecto de la acidificación en el desarrollo de dos etapas larvales de la almeja Panopea globosa
  • Identificación molecular de Porites evermanni: análisis morfológico y óptico de dos morfotipos en el Pacífico mexicano
  • Respuestas fisiológicas y bioenergéticas del pez payaso Amphiprion ocellaris (Cuvier, 1830) bajo condiciones óptimas de temperatura y salinidad
  • Actualización del Bird Strike Risk Index (BR12) para México y su aplicación en el Aeropuerto Internacional de La Paz, Baja California Sur, como caso de estudio
  • Efecto de las actividades de vehículos fuera de camino en el paisaje de Baja California
  • Evaluación del crecimiento y composición bioquímica de cianobacterias como alternativas nutricionales para humanos
  • Bioprospección de extractos microalgales con potencial aplicación biomédica
  • Producción de polihidroxialcanoatos en dos cepas de la cianobacteria Synechocystis sp. PCC 6803 en cultivos adicionados con agua del proceso de producción de aceite de oliva
  • Aplicación de alimentos funcionales adicionados con probióticos del género Bacillus en el cultivo de tilapia del Nilo (Oreochromis niloticus) para la optimización de respuesta frente a infecciones bacterianas.
  • Análisis cuantitativo del metiloma en hembras y embriones de Octopus maya bajo condiciones de estrés térmico
  • Plasticidad fenotípica de dos poblaciones de la almeja mano de león (Nodipecten subnodosus) ante variaciones térmicas in situ: una aproximación transcriptómica
  • Análisis transcriptómico de la almeja mano de león (Nodipecten subnodosus) bajo condiciones térmicas oscilatorias en dos localidades de la península de Baja California
  • Termosensibilidad y capacidad adaptativa de adultos Octopus maya: Evaluación de la función mitocondrial y capacidad antioxidante
  • Análisis genómico de dos especies de aves marinas en México: perspectivas adaptativas y poblacionales
  • Bioprospección de metabolitos secundarios con actividad antioxidante y potencial antiinflamatorio producidos por cianobacterias y microalgas
  • Bioprospección y caracterización de cianobacterias con potencial biofertilizante en el cultivo de fresa (Fragaria x ananassa Duch)
  • Distribución, diversidad y toxicidad de dinoflagelados de los géneros Gambierdiscus y Fukuyoa (Dinophyceae) en zonas costeras de la región del Caribe
  • Diversidad de dinoflagelados del género Coolia (Dinophyceae) en costas de México
  • Efecto de la temperatura en el metiloma y transcriptoma de hembras de Octopus maya y su progenie
  • Efecto de las bacterias asociadas a la ficósfera en el crecimiento y la producción de toxinas del dinoflagelado Lingulodinium polyedra
  • Efecto de las nanopartículas de silicio en la producción de pigmentos y yessotoxina en el dinoflagelado Lingulodinium polyedra (Dinophyceae) bajo condiciones de cultivo
  • Efectos de las temperaturas de aclimatación en la ecofisiología de especies templadas y tropicales, microestructura y mineralogía de poliquetos tubícolas calcificadores del género Spirobranchus Blainville, 1818
  • Estructura y función de la comunidad microbiana involucrada en el ciclo del metano en la región de aguas profundas del Golfo de México
  • Fortificación de la harina de maíz con cianobacterias para incrementar la calidad nutricional para consumo humano
  • Mecanismos fisiológicos de aclimatación y resiliencia de Porites panamensis (Scleractinia: Poritidae) en Bahía de los Ángeles.