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Dirección de Estudios de Posgrado

Biotecnología y Genómica de Organismos Acuáticos

Los proyectos desarrollados en esta LGAC se basan principalmente en el uso de herramientas y técnicas de última generación enfocadas en diferentes áreas de aplicación. A través de la caracterización molecular y de la identificación filogenética, se realiza la bioprospección y el estudio de la biodiversidad de organismos acuáticos; se investigan los mecanismos moleculares de la expresión genética, y se desarrollan microorganismos recombinantes sobreproductores de metabolitos bioactivos, fundamentales para la obtención de compuestos de alto valor agregado de importancia biotecnología e industrial.

  • Díaz Herrera Fernando
  • Durán Riveroll Lorena María
  • Galindo Sánchez Clara Elizabeth
  • Lizárraga Partida Marcial Leonardo
  • Olmos Soto Jorge
  • Ponce Rivas Elizabeth
  • Re Araujo Ana Denise
  • Sánchez Castrejón Edna

  • Ponce Vélez, M. G., Lago Reynoso, F., Castañeda Chávez, M. R., Marcovecchio, J., Lizárraga Partida, M. L., Vázquez Botello, A., Arias, A., Horta Puga, G., Briones Venegas, A. N., & Rendón Lugo, A. N. (2023). Acciones de prevención y reducción de la contaminación marina. In Rivera-Arriaga E., Azuz Adeath I. (Eds.), La década del océano en México 2021-2030: La ciencia que necesitamos (pp. 29-53). Universidad Autónoma de Campeche. (ID: 28871)
  • Gasca Pineda, J., Galindo Sánchez, C. E., Martínez Mercado, M. A., Jiménez Rosemberg, P., Hereu Romero, C. M., Nakamura, Y., Herzka Llona, S. Z., Compairé, J. C., Gómez Reyes, R. J. E., Flores Robles, J., Saavedra Flores, A., & Arteaga Uribe, M. C. (2023). Community structure and diversity of five groups of zooplankton in the Perdido region of the Gulf of Mexico using DNA metabarcoding. AQUATIC ECOLOGY. doi: 10.1007/s10452-022-10002-w. (ID: 28856)
  • Ángeles González, L. E., Re Araujo, A. D., Díaz Herrera, F., Caamal Monsreal, C., Rodriguez Fuentes, G., Galindo Sánchez, C. E., Mascaro Miquelajauregui, M., Pascual, C., & Rosas Vazquez, C. (2023). Thermal optimality and physiological parameters inferred from experimental studies scale latitudinally with marine species occurrences. Journal of Thermal Biology, 114, 103495. doi: 10.1016/j.jtherbio.2023.103495. (ID: 28798)
  • Larios Soriano, E., Díaz Herrera, F., Re Araujo, A. D., Lopez Acuña, L., Lopez Galindo, L. L., True, C. D., Alvarez, C. A., & Galaviz Espinoza, M. A. (2023). Influence of temperature on respiratory metabolism during early development of Totoaba macdonaldi. Latin American Journal of Aquatic Research, 51(1), 109-116. doi: 10.3856/vol51-issue1-fulltext-2952. (ID: 28732)
  • Dominguez Castanedo, O., Palomino Cruz, D., Mascaro Miquelajauregui, M., Rodriguez Fuentes, G., Juárez Valdez, O. E., Galindo Sánchez, C. E., Caamal Monsreal, C., Galindo Torres, P., Díaz Herrera, F., & Rosas Vazquez, C. (2023). Trans-generational physiological condition of embryos is conditioned by maternal thermal stress in Octopus maya. Marine Biology, 170(41), 1-14. doi: 10.1007/s00227-023-04183-7. (ID: 28731)
  • Garcia Rueda , A., Mascaro Miquelajauregui, M., Rodriguez Fuentes, G., Caamal Monsreal , P., Díaz Herrera, F., Paschke Lamana, K., & Rosas Vazquez, C. (2023). Moderate hypoxia mitigates the physiological effects of high temperature on the tropical blue crab Callinectes sapidus. Frontiers in Physiology, 13(1), 1089164. doi: 10.3389/fphys.2022.1089164. (ID: 28667)
  • Olmos Soto, J., López Acuña, L. M., Gorriño Ames, A., Galaviz Espinoza, M. A., & Mercado Guajardo, V. E. (2022). Bacillus subtilis Effects on Growth Performance and Health Status of Totoaba macdonaldi Fed with High Levels of Soy Protein Concentrate. Animals, 12(23), 3422. doi: 10.3390/ani12233422. (ID: 28154)
  • Paniagua Michel, J. J. (2022). Marine Natural Products: Bioactive Isoprenoids and Provitamin A Carotenoids. In Se Kwon Kim (Eds.), Marine Biochemistry (primera ed., pp. 119-128). CRC Press LLC. (ID: 28245)
  • Díaz Herrera, F., Re Araujo, A. D., Lafarga de la Cruz, F., & Tripp Valdez, M. A. (2022). Thermal preference and tolerance of the black abalone Haliotis chacherodii (Leach 1814) (Gastropoda : Prosobranchia). Pacific Science, 76(2), 111-121. doi: 10.2984/76.2.2. (ID: 27708)
  • Keller-Costa, T., Kozma, L., Silva, S., Toscan, R., Gonçalves, J. M., Lago Lestón, M. A., Kyrpides, N., Nunes da Rocha, U., & Costa, R. (2022). Metagenomics-resolved genomics provides novel insights into chitin turnover, metabolic specialization, and niche partitioning in the octocoral microbiome. Microbiome, 10(151), 20. doi: 10.1186/s40168-022-01343-7. (ID: 28183)
  • Pacheco Sandoval, A. M., Lago Lestón, M. A., Abadia Cardoso, A., Solana Arellano, M. E., & Schramm Urrutia, Y. (2022). Age as a primary driver of the gut microbial composition and function in wild harbor seals. Scientific Reports, 12(14641), 12. doi: 10.1038/s41598-022-18565-2. (ID: 28184)
  • Chavez Solis , E., Díaz Herrera, F., Paschke Lamana, K., Re Araujo, A. D., Rosas , C., Rodriguez Fuentes, G., Tremblay, N., & Mascaro Miquelajauregui, M. (2022). Physiological characterization of Typhlatya cave shrimps: linking habitat with aerobic metabolism. Frontiers in Marine Science, 9(1), 892274. doi: 10.3389/fmars.2022.892274. (ID: 27835)
  • Mercado Guajardo, V. E., & Olmos Soto, J. (2022). Bacteriocin Production by Bacillus Species: Isolation, Characterization, and Application. Probiotics and Antimicrobial Proteins, 14(6), 1151-1169. doi: 10.1007/s12602-022-09966-w. (ID: 28156)
  • Ponce Rivas, E. (2022, Julio). Cianobacterias y su aplicación biotecnológica. Congreso Nacional Virtual Sociedad Científica Juvenil (SCJ) 2022. Ensenada, México (ID: 27858)
  • Domínguez Estrada, A. C., Galindo Sánchez, C. E., Ventura López, C., Rosas Vasquez, C., & Juárez Valdez, O. E. (2022). Response of optic gland pathways to thermal stress in the reproductive phase of female Octopus maya. Journal of Molluscan Studies. doi: 10.1093/mollus/eyac018. (ID: 28367)
  • Del Vecchio, G., Galindo Sánchez, C. E., Tripp Valdes, M., López Landavery, E. A., Rosas Vasquez, C., & Mascaro Miquelajauregui, M. (2022). Transcriptomic response in thermally challenged seahorses Hippocampus erectus: The effect of magnitude and rate of temperature change. Comparative Biochemistry and Physiology Part B: Biochemistry and Molecular Biology, 262, 110771. doi: 10.1016/j.cbpb.2022.110771. (ID: 28195)
  • López Landavery, E. A., Amador Cano , G., Tripp Valdez, M. A., Ramirez Alvarez, N., Cicala, F., Gómez Reyes, R. J. E., Díaz Herrera, F., Re Araujo, A. D., & Galindo Sánchez, C. E. (2022). Hydrocarbon exposure effect on energetic metabolism and immune response in Crassostrea virginica. Marine Pollution Bulletin, 180(1), 113738. doi: 10.1016/j.marpolbull.2022.113738. (ID: 28192)
  • Vargas Peralta, C. E., Galindo Sánchez, C. E., Araneda, C., Hyde, J. R., Larrain, M. A., Valenzuela Quiñonez, F., del Río Portilla, M. Á., & Lafarga de la Cruz, F. (2022, Mayo). Genetic and genomic tools for abalone identification species of the Baja California peninsula. World Aquaculture 2021. Mérida, México (ID: 28433)
  • Juárez Valdez, O. E., Arreola Meraz, P. L., Sánchez Castrejón, E., Hernández Avila-Poveda, O., López Galindo, L. L., Rosas Vasquez, C., & Galindo Sánchez, C. E. (2022). Oviducal gland transcriptomics of Octopus maya through physiological stages and the negative effects of temperature on fertilization. PeerJ. doi: 10.7717/peerj.12895. (ID: 27763)
  • Vargas Peralta, C. E., Araneda, C., Galindo Sánchez, C. E., Larrain, M. A., del Río Portilla, M. Á., & Lafarga de la Cruz, F. (2022). Species identification in Haliotis genus from the northeastern Pacific Ocean using genome-wide RAD-SNPs. FOOD CONTROL, 138(108979), 7. doi: 10.1016/j.foodcont.2022.108979. (ID: 27824)
  • Ponce Rivas, E., Camacho Jiménez, L., Díaz Herrera, F., Sánchez Castrejón, E., & Montiel Arzate, A. (2021, Noviembre). Na+/K+-ATPase expression and osmotic effects of recombinant crustacean hyperglycemic hormone CHH-B1 in the Pacific white shrimp Litopenaeus vannamei. 3rd Online International Conference on Aquaculture and Fisheries. London, Reino Unido (ID: 27131)
  • Lizárraga Partida, M. L., Bernáldez Sarabia, J., Hernández López, E. L., Gasperin Bulbarela, J., Licea Navarro, A. F., Guerrero, A., Sánchez Castrejón, E., & Franco Moreno, A. (2021). Distribution of pathogenic vibrios and Vibrio spp. in the water column and sediment samples from the southern Gulf of Mexico. Marine Pollution Bulletin. doi: 10.1016/j.marpolbul.2021.113116. (ID: 27124)
  • Cicala, F., Arteaga Uribe, M. C., Herzka Llona, S. Z., Hereu Romero, C. M., Jimenez Rosenberg, S. P. A., Saavedra Flores, A., Robles Flores, J., Gómez Reyes, R. J. E., Batta Lona, P. G., & Galindo Sánchez, C. E. (2021). Environmental conditions drive zooplankton community structure in the epipelagic oceanic water of the southern Gulf of Mexico: A molecular approach. Molecular Ecology, 31(2), 546-561. doi: 10.1111/mec.16251. (ID: 27261)
  • Cembella, A. D., Durán Riveroll, L. M., Tarazona Janampa, U., Okolodkov, Y. B., García Sandoval, R., Krock, B., Hörtsmann, C., & John, U. (2021). Phylogeography and Diversity Among Populations of the Toxigenic Benthic Dinoflagellate Prorocentrum From Coastal Reef Systems in Mexico. Frontiers in Marine Science, 8, 1-19. doi: 10.3389/fmars.2021.716669. (ID: 27088)
  • Lizárraga Partida, M. L., Guerrero, A., & Gómez-Gil Rodriguez, B. (2021). Genomic stability among O3:K6 V. parahaemolyticus pandemic strains isolated between 1996 to 2012 in American countries. BMC Genomic Data. doi: 10.1186/s12863-021-00985-0. (ID: 27062)

  • Efecto de la acidificación en el desarrollo de dos etapas larvales de la almeja Panopea globosa
  • Identificación molecular de Porites evermanni: análisis morfológico y óptico de dos morfotipos en el Pacífico mexicano
  • Respuestas fisiológicas y bioenergéticas del pez payaso Amphiprion ocellaris (Cuvier, 1830) bajo condiciones óptimas de temperatura y salinidad
  • Actualización del Bird Strike Risk Index (BR12) para México y su aplicación en el Aeropuerto Internacional de La Paz, Baja California Sur, como caso de estudio
  • Efecto de las actividades de vehículos fuera de camino en el paisaje de Baja California
  • Evaluación del crecimiento y composición bioquímica de cianobacterias como alternativas nutricionales para humanos
  • Bioprospección de extractos microalgales con potencial aplicación biomédica
  • Producción de polihidroxialcanoatos en dos cepas de la cianobacteria Synechocystis sp. PCC 6803 en cultivos adicionados con agua del proceso de producción de aceite de oliva
  • Aplicación de alimentos funcionales adicionados con probióticos del género Bacillus en el cultivo de tilapia del Nilo (Oreochromis niloticus) para la optimización de respuesta frente a infecciones bacterianas.
  • Análisis cuantitativo del metiloma en hembras y embriones de Octopus maya bajo condiciones de estrés térmico
  • Análisis transcriptómico de la almeja mano de león (Nodipecten subnodosus) bajo condiciones térmicas oscilatorias en dos localidades de la península de Baja California
  • Distribución, diversidad y toxicidad de dinoflagelados de los géneros Gambierdiscus y Fukuyoa (Dinophyceae) en zonas costeras de la región del Caribe
  • Efecto de la temperatura de aclimatación en la respuesta fisiológica del poliqueto tubícola calcificador Spirobranchus spinosus
  • Efecto de la temperatura en el metiloma y transcriptoma de hembras de Octopus maya y su progenie
  • Mecanismos fisiológicos de aclimatación y resiliencia de Porites panamensis (Scleractinia: Poritidae) en Bahía de los Ángeles.
  • Plasticidad fenotípica de dos poblaciones de la almeja mano de león (Nodipecten subnodosus) en condiciones de estrés térmico: una aproximación transcriptómica
  • Sucesión de las comunidades microbianas en el lago cráter Santa María del Oro
  • Termosensibilidad y capacidad adaptativa de adultos Octopus maya: Evaluación de la función mitocondrial y capacidad antioxidante