Con el fin de motivar la investigación científica del medio ambiente regional, en el Laboratorio de Pronóstico Meteorológico se elabora cotidianamente un pronóstico del tiempo para la Ciudad de Ensenada y los valles circunvecinos, así como un pronóstico ocasional para el B/O Alpha Helix cuando éste navega, así como pronósticos meteorológicos numéricos para la península de Baja California.También se elabora un pronóstico estacional de la precipitación pluvial para la región. Por otro lado se supervisan estaciones meteorológicas en Ensenada, BC., La Paz, BCS., y Tepic, Nay. y se monitorean, con diversos recursos de percepción remota, las condiciones meteorológicas de la península de Baja California. El personal científico adscrito a este laboratorio realiza investigación en climatología de México y en las metodologías utilizadas para la modelación numérica de la atmósfera. Las aplicaciones de dicho trabajo incluyen el pronóstico numérico del tiempo meteorológico y de la calidad del aire, así como el estudio de fenómenos meteorológicos extremos como los ciclones tropicales y el estudio de los mecanismos responsables de la variabilidad climática en múltiples escalas de tiempo.